以水系景观是肇庆新区的一大特色。目前，99公顷的砚阳湖已基本完工，犹如一颗绿色明珠，让肇庆新区焕发生机。以砚阳湖为代表的肇庆新区水系景观不仅展示了岭南水乡城市的传统美态，也体现了肇庆新区“绿色城市”的建设理念。
肇庆新区与鼎湖区相连，建自万亩鱼塘，拥有非常丰富的水资源。水自鼎湖区九龙湖进入肇庆新区，沿着丰乐渠、长利河、砚阳湖、横槎涌一级一级流动，最后汇入西江，实现自然水力流动。大部分土地实现自流式灌溉，调节城市生态系统，水系串起起伏的山脉，形成山水相连、物种多样的低冲击滨水景观格局。因此，肇庆新区建设之初，就把如何做好“水文章”作为规划的重要内容，共规划近40公里的碧道，串联起肇庆新区重点区域。
根据流动轨迹，肇庆新区的水系景观一共分成“北、中、南”三段。北段以九龙湖为起点，其生态自然基底良好，水生植物丰富且湿地水质优良，有着品种丰富的乔木，水岸遍布芦苇等水生植物。因此在北段，肇庆新区以“湿地”为主题，规划了湿地公园、湿地科普基地、湿地游览路线等项目，而且湿地具有净水功能，对于改善水环境、保护生物多样性起着微妙的调节作用。
中段则以“鹭鸟飞翔”为景观特色，既有果树吸引小型鸟类栖息，又有浅滩区吸引候鸟，砚阳湖即位于中段。中段以“文化艺术”为主题，规划了文化艺术公园、博物馆等项目。
南段连通长利涌直达西江，水乡特质明显。该段以“时尚娱乐”为主题，华侨城卡乐小镇项目即在该段，另还有地标观光塔等。
目前，肇庆新区水系景观正按照规划推进建设。其中砚阳湖已基本完工，华侨城、观光塔等已动工。值得一提的是，肇庆新区水系景观充分融入海绵城市的生态建设理念，如在砚阳湖的沿湖步道使用透水混凝土，可实现降水的自然下渗；水系沿线的驳岸以礁石木桩取代过去的水泥混凝土，营造美丽自然景观的同时，同样起到自然渗透的作用；在水系沿线，通过湿地与树木植栽，营造绿树成荫的步行环境，并形成铁路与公园之间的绿色隔音屏障，不仅游人舒服，也成为鸟类的休憩空间。
值得一提的是，肇庆新区水系的源头九龙湖可谓自然生态大观园，其拥有森林生态系统、湖泊生态系统、湿地生态系统、农业生态系统等多种自然生态系统类型。其集水面积145平方公里，年均产水量达1.2亿立方米，水质常年保持地表Ⅱ类水标准。九龙湖长年呈现“一湖碧水，十溪汇流，百鸟争鸣，千顷森林，万亩水面”的美景。目前，九龙湖沿线的村庄正进行管网及污水治理设施的建设，沿线工程即将完工，将进一步提高九龙湖的水质，使肇庆新区水系更美更清。
